پایان نامه ارشد:بررسی مقایسهای پروفایل پروتئینی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس و مایکوباکتریوم بوویس به روش SDS-PAGE |
فهرست نمودارها
2-1: میزان بروز بیماری سل در طول 46 سال گذشته در ایران
41
4-1: نتایج کشت مثبت
92
4-2: منحنی استاندارد
98
فهرست جداول
2-1: تاکسونومی اعضای کمپلکس توبرکلوزیس
15
2-2: داروهای خط دوم درمان توبركلوزیس
32
2-3: تخمین موارد ومتوسط میزان بروز سل در جهان در سال2010
40
2-4: به تفکیک دانشگاههای علوم پزشکی کشور
42
2-5: برخی تغییرات ژنی در سویههای BCG M. Bovis
47
3-1: نحوه گزارش میکروسکوپی
71
3-2: مواد تشکیلدهنده بافرتخلیص
81
3-3: مواد تشکیلدهنده محلول PBS X10
83
3-4: مواد تشکیلدهنده محلول برادفورد
85
3-5: مواد تشکیلدهنده Running Buffer 10%
86
3-6: مواد تشکیلدهنده Coomassie Gel Stain
87
3-7: مواد تشکیلدهنده Coomassie Gel Destain
87
3-8: مواد تشکیلدهنده Fixation Solution
87
3-9: مواد تشکیلدهنده Stainining Solution
88
3-10: مواد تشکیلدهنده ژل 10%,12.5% Separating
89
3-11: مواد تشکیلدهنده ژل Stacking 5%
89
4-1: درصد نمونههای بالینی
93
4-2: نتایج تستهای بیوشیمیایی
96
4-3: نتایج تستهای حساسیت آنتیبیوتیکی و TCH
97
فهرست تصاویر
2-1: استخوان سـتون فقرات بدشـکل در مومیایی، بهدلیل بیماری سـل
11
2-2: عکسبرداری توسط میکروسکوپ الکترونی از مایکوباکتریوم توبرکلوزیس
16
2-3: کلنیهای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس روی محیط لونشتاین جانسون
17
2-4: نمای شماتیک ازساختمان دیواره مایکوباکتریوم توبرکلوزیس
22
2-5: میزان بروز مایکوباکتریوم توبرکلوزیس درنقاط مختلف جهان در سال 2012
40
2-6: درخت تبارشناسی زیرسویههای مختلف BCG M. Bovis بر اساس اطلاعات پراکندگی آنها و خصوصیات مولکولی
46
2-7: برخی از عکسهای تاریخی مربوط به کاشفان واکسن ب ث ژ
49
3-1: مرحله دیالیز
84
3-2: آمادهسازی صفحات شیشهای
88
4-1: باسیل اسید فست در رنگ امیزی اورامین
93
4-2: باسیل اسید فست در رنگ امیزی ذیل-نلسون
94
4-3: فاکتور طنابی (Cord Factor)
95
4-4: تفسیر تست نیترات
95
4-5: باندهای پروتئینهای غشایی سویههای M. Bovis و M. TB ، استخراج پروتئین به روش آمونیوم سولفات، ژل 10% و رنگ آمیزی آمیزی کوماسی بلو R-250
99
4-6: باندهای پروتئینهای غشایی سویههای M. Bovis و M. TB ، استخراج پروتئین به روش آمونیوم سولفات، ژل 10% رنگ آمیزی Blue Silver Staining
100
4-7: باندهای
پروتئینهای ترشحی سویههای M. Bovis و M. TB
101
5-1: تصویر A سویهM. Tuberculosis H37Rv و تصویرB سویه مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساس
106
چکیده
مایکوباکتریوم توبرکلوزیس عامل بیماری سل میباشد. از زمانی که سازمان جهانی بهداشت در سال 1993، توبرکلوزیس را به عنوان یک فوریت اعلام نمود، تا کنون کنترل آن به دلیل وجود سوشهای مقاوم به درمان و تداخل با بیماری ایدز دچار مشکل شده است. مایکوباکتریوم بوویس به عنوان عامل سل گاوی به صورت موردی انسان را نیز درگیر می کند و به عنوان یکی از معضلات بهداشتی با گستره جهانی محسوب میشود. مبارزه با این آلودگی امروزه باعث گسترش بررسی آنتیژنهای باکتری به منظور دسترسی بیومارکرهای موثر در تشخیص، اهداف دارویی و اجزای واکسن مورد اهمیت واقع شدهاند.
جهت مقایسه پروفایل پروتئینی سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساس به درمان و مایکوباکتریوم بوویس از کل نمونههای ارسالی 6 ماهه اول سال 1392 به بخش مایکوباکتریولوژی انسیتو پاستور، 100 نمونه مورد ارزیابی قرار گرفت. در ابتدا نمونههای کلینیکی با روش ان استیل- ال سیستئین- هیدروکسید سدیم و در محیط کشت لونشتاین جانسون کشت داده شد و جهت افتراق مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساس و مایکوباکتریوم بوویس از سایر مایکوباکتریومها، از تستهای بیوشیمیایی (نیترات، کاتالاز، نیاسین و TCH) و حساسیت آنتی بیوتیکی استفاده شد. کلونیها در محیط میدل بروک 7H9 کشت داده شد، پس از برداشت کلونیهای جدید، به منظور استخراج پروتئینهای ترشحی و غشایی از روشهای سونیکاسیون، رسوب دهی با سولفات آمونیوم و الکل استفاده گردید و به وسیله روش برادفورد تعیین غلظت شد و در نهایت مقایسه با روش الکتروفورز تک بعدی انجام پذیرفت.
با بررسی باندهای حاصله از پروتئینهای غشایی و ترشحی در 5 سویه کلینیکی متفاوت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساس هیچگونه تفاوتی مشاهده نشد و همچنین در 5 سویه کلینیکی متفاوت مایکوباکتریوم بوویس نیز تفاوتی مشاهده نشد. در سویههای مایکوباکتریوم بوویس، برای پروتئینهای غشایی باندهایی در محدوده 15 تا 85 کیلودالتون مشاهده شد و در سویه مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساس نیز باندهای از 15 تا 120 کیلودالتون مشاهده شد این دو سویه در محدودههای وزنی تقریبا 30 تا 116 کیلو دالتون بسیار متفاوت بودهاند.
در بررسی پروتئینهای ترشحی در سویههای مایکوباکتریوم بوویس، باندهایی در محدوده 15 تا 115 کیلودالتون و در سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساس باندهایی از 18 تا 114 کیلودالتون مشاهده شدند که اختلافات وزنی کمی در این محدودهها مشاهده شد.
نتایج حاصل از تفکیک باندهای پروتئینی سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساس، حاکی از شباهت نسبی با سویه استانداردM. tuberculosis H37Rv نسبت به مطالعات دیگر است. اختلافات مشاهده شده در باندهای حاصله از هر دو نوع پروتئینهای سویههای مایکوباکتریوم بوویس و مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساس میتواند مرجعی برای بررسیهای بیشتر پروتئومیکس در باکتری مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساس و بوویس باشد.
به نظر میرسد اختلاف بیان باندهای پروتئینی سویههای حساس و بوویس با به کارگیری روشهای مناسب میتواند به عنوان پروتئین مارکر و یا حتی بیومارکر موثر در تشخیص سویههای حساس و بوویس از یکدیگر، اهداف دارویی و اجزای واکسن قابل استفاده باشد.
فصل اول
[سه شنبه 1398-07-16] [ 12:12:00 ق.ظ ]
|